QTc间期延长
注射用伏立康唑治疗与患者的QTc间期延长存在相关性，目前极少数患者报告出现尖端扭转型室性心动过速。这部分患者通常伴有一些心血管系统的危险因素，如患有心肌病、低钾血症等，因此在伴心律失常危险因素的患者中，需慎用使用该药物。
静脉滴注相关反应
在使用注射用伏立康唑的患者中，曾发生过静脉滴注相关的反应，主要表现为潮红和恶心，医师应根据患者症状的严重程度，考虑是否暂停使用该药。
肝肾及胰腺毒性
临床研究中，接受治疗的患者报告发生包括肝炎，胆汁瘀积和致死性的暴发性肝衰竭在内的严重的肝脏反应和肾功能衰竭，所有患者均需定期监测肝功能，治疗的第一个月内，至少每周检查一次，且治疗时间越短越好，如未发生改变，肝功能检查频率降为每月一次，若出现实验室检查异常，需评估患者是否继续用药，通常停药后肝功能异常可立即改善。同时监测患者的肾功能，特别是实验室检查中，血肌酐值的变化。
此外，最近接受过化疗，造血干细胞移植的患者，可能存在急性胰腺炎的高危因素，需在治疗期间密切监测胰腺功能，尤其是血清淀粉酶或脂肪酶的变化。
视觉不良反应
已有报道称，患者在使用该药时会发生视觉不良反应，主要表现为视神经炎、视物模糊和视神经乳头水肿。目前尚不明确注射用伏立康唑治疗超过28天是否会对视觉功能造成影响，但若持续使用该药治疗超过28天，需随时监测视觉功能，包括视敏度、视野以及色觉的变化情况。
严重皮肤不良反应
治疗期间，存在危及生命的严重皮肤不良反应(SCARs)的潜在风险，患者有可能会发生中毒性表皮坏死松解症(TEN)、史蒂文斯-约翰逊综合征(SJS)、药物反应伴噬酸性粒细胞增多和全身性症状(DRESS)，因此若患者出现皮疹，需严密观察，若皮损逐渐加重，需停止该药的治疗。
光毒性
伏立康唑与光毒性有关，患者接受注射用伏立康唑治疗可能会出现一系列光毒性，发生雀斑样痣、雀斑、光化性角化病和假性卟啉症等，建议所有患者接受该药治疗期间，应避免日光直射，且穿着恰当的防护服和涂抹高防晒因子(SPF)的防晒霜等。
肾上腺事件
接受其他唑类药物治疗的患者，曾报告发生肾上腺功能不全，而接受该药治疗的患者，曾报告过可逆性肾上腺功能不全。因此对于接受伏立康唑或皮质类固醇长期治疗的患者，须在治疗期间和治疗后，密切观察是否出现肾上腺皮质功能障碍。
